1998年11月27日，黑龍江墾區(qū)審時(shí)度勢(shì)、果斷決策，將優(yōu)勢(shì)資源進(jìn)行戰(zhàn)略性重組，組成了黑龍江北大荒農(nóng)業(yè)股份有限公司（以下簡(jiǎn)稱公司）。

公司經(jīng)國(guó)家經(jīng)貿(mào)委批準(zhǔn)，由具有60年發(fā)展歷史的中國(guó)500強(qiáng)企業(yè)——北大荒農(nóng)墾集團(tuán)總公司（以下簡(jiǎn)稱集團(tuán)公司）做為獨(dú)家發(fā)起人，注冊(cè)資本為163429.2萬(wàn)元。

北大荒股份下轄友誼、七星、青龍山等16個(gè)農(nóng)業(yè)分公司和浩良河化肥分公司，控股北大荒米業(yè)有限公司、北大荒紙業(yè)有限公司和龍墾麥芽有限公司，是我國(guó)目前規(guī)模最大、現(xiàn)代化水平最高的農(nóng)業(yè)類股份有限公司和商品糧生產(chǎn)基地，具有明顯的規(guī)模、資源、技術(shù)、裝備、管理及綠色產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)。

2002年3月29日9時(shí)26分，這是一個(gè)必將永遠(yuǎn)載入北大荒史冊(cè)的時(shí)刻。就在這一刻，北大荒農(nóng)業(yè)股份有限公司A股30000萬(wàn)股股票在亞洲最大的證券交易市場(chǎng)——上海證券交易所正式上市，標(biāo)志著在中國(guó)資本市場(chǎng)上也有了“北大荒”的一席之地。

以此為起點(diǎn)，北大荒的國(guó)際化、市場(chǎng)化、現(xiàn)代化進(jìn)程進(jìn)一步提速，一個(gè)巨大的舞臺(tái)徐徐打開。

公司擁有936萬(wàn)畝耕地和360萬(wàn)畝可墾荒地。這里有北大荒精神萌發(fā)成長(zhǎng)的歷史積淀，是一方具有獨(dú)特發(fā)展優(yōu)勢(shì)的神奇熱土。

公司承擔(dān)起建立績(jī)優(yōu)誠(chéng)信的農(nóng)業(yè)上市公司的重任，各級(jí)領(lǐng)導(dǎo)班子以做優(yōu)做大做強(qiáng)北大荒股份，使公司成為產(chǎn)業(yè)化、股份化、集團(tuán)化的現(xiàn)代農(nóng)業(yè)企業(yè)為已以任，積極實(shí)施現(xiàn)代農(nóng)業(yè)裝備工程，建立優(yōu)質(zhì)農(nóng)產(chǎn)品基地，穩(wěn)定提高糧食生產(chǎn)能力，擴(kuò)大無(wú)公害、綠色、有機(jī)食品的生產(chǎn)比重；實(shí)施以龍頭企業(yè)為牽動(dòng)力的產(chǎn)業(yè)化經(jīng)營(yíng)，實(shí)施大招商、大流通及資本運(yùn)作，創(chuàng)造農(nóng)業(yè)股份公司經(jīng)濟(jì)增長(zhǎng)的新優(yōu)勢(shì)，被稱為中國(guó)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的排頭兵。

秉承北大荒集團(tuán)深厚的歷史與文化底蘊(yùn)，以優(yōu)異的經(jīng)營(yíng)業(yè)績(jī)和對(duì)股東的豐厚回報(bào)，公司在中國(guó)資本市場(chǎng)上演繹著前無(wú)古人的精彩傳奇，其“中國(guó)農(nóng)業(yè)藍(lán)籌第一股”的形象已然確立。

2003，公司被“中國(guó)上市公司百?gòu)?qiáng)高峰論壇”評(píng)為中國(guó)上市公司百?gòu)?qiáng)第97名。

2004年，公司實(shí)施撤隊(duì)建區(qū)改革，撤銷43個(gè)分場(chǎng)和676個(gè)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)隊(duì)建制，集中建立148個(gè)管理區(qū)，分流2301名管理人員，減少了管理層次，壓縮管理費(fèi)用5150萬(wàn)元。這一年，公司總資產(chǎn)達(dá)86.53億元，股東權(quán)益為40%億元，主營(yíng)業(yè)務(wù)收為32.05億元，利潤(rùn)總額為4.49億元，凈利潤(rùn)為4.46億元。

2004年12月28日，上海證券交易所正式宣布：將于2005年首個(gè)交易日起，發(fā)布上證紅利指數(shù)，公司被選為首批樣本股。

公司產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整成效顯著。2004年以來(lái)，公司成功收購(gòu)了米業(yè)集團(tuán)、紙業(yè)公司，與集團(tuán)公司共同出資設(shè)立龍墾麥芽公司，成功完成浩化“油改煤”工程，注入資金使龍頭企業(yè)規(guī)模不斷擴(kuò)大，米業(yè)公司加工能力在原有基礎(chǔ)上增加了30萬(wàn)噸；紙業(yè)公司生產(chǎn)能力在原有基礎(chǔ)上增加了3.5萬(wàn)噸；浩化改變了產(chǎn)品結(jié)構(gòu)單一的局面，新上10萬(wàn)噸甲醇生產(chǎn)項(xiàng)目；龍墾麥芽公司在原有基礎(chǔ)上擴(kuò)增生產(chǎn)能力10萬(wàn)噸。

從公司上市到2005年，公司用于農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)設(shè)施的投資共計(jì)8.1億元。建設(shè)了35個(gè)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)裝備試驗(yàn)區(qū)，新增大型農(nóng)業(yè)機(jī)械2887臺(tái)，農(nóng)機(jī)裝備水平極大提高，田間作業(yè)綜合機(jī)械化率達(dá)到93%以上，農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化、農(nóng)業(yè)科技水平顯著提高，糧食綜合生產(chǎn)能力大幅度增強(qiáng)。農(nóng)業(yè)基礎(chǔ)設(shè)施不斷完善。優(yōu)化種植業(yè)結(jié)構(gòu)，積極擴(kuò)大水稻、玉米等高產(chǎn)高效作物的面積。

2005年7月，第二屆中國(guó)最具生命力百?gòu)?qiáng)企業(yè)排名在北京揭曉，黑龍江北大荒農(nóng)業(yè)股份有限公司是入榜的黑龍江省4家企業(yè)之一，在百?gòu)?qiáng)榜中列第60名。

2005年7月，公司投資建設(shè)的北大荒米業(yè)建三江30萬(wàn)噸稻谷綜合加工項(xiàng)目開工建設(shè)，項(xiàng)目投資總額2.2億人民幣，每年可加工水稻30萬(wàn)噸，可生產(chǎn)精制大米20萬(wàn)噸、米糠油2400噸、米糠粕2萬(wàn)噸和少量谷維素。

2005年7月30日，公司投資建設(shè)的浩良河化肥分公司日產(chǎn)333噸甲醇項(xiàng)目正式開工，這一項(xiàng)目的實(shí)施，將使浩化改變多年的產(chǎn)品品種單一的局面，增加抵御市場(chǎng)風(fēng)險(xiǎn)的能力，經(jīng)濟(jì)效益也將大幅度提高。

2005年9月，經(jīng)過(guò)北京聯(lián)合資信評(píng)估有限公司的評(píng)估，黑龍江北大荒農(nóng)業(yè)股份有限公司獲得了A-1+頂級(jí)信用。11月，中國(guó)上市公司綜合競(jìng)爭(zhēng)力20強(qiáng)企業(yè)評(píng)選活動(dòng)中，公司憑借出色的規(guī)模競(jìng)爭(zhēng)力、效率競(jìng)爭(zhēng)力等指標(biāo)成功上榜。

2005年糧食總產(chǎn)量為343.2萬(wàn)噸，較上市之初的295.79萬(wàn)噸增長(zhǎng)16%；實(shí)現(xiàn)主營(yíng)業(yè)務(wù)收入44.45億元，較上市之初的14.7億元增長(zhǎng)202%；企業(yè)利潤(rùn)水平穩(wěn)定提高，2005年實(shí)現(xiàn)利潤(rùn)4.9億元，比2002年的3.8億元增長(zhǎng)29%；人均純收入由2002年的3500元提高到2005年的6450元，增長(zhǎng)84%。截至2005年底，公司資產(chǎn)總額為89億元，凈資產(chǎn)為44億元，分別比上市之初的62億元和35億元增長(zhǎng)43%和26%。2005年凈資產(chǎn)收益率為11.08%。累計(jì)分配紅利5.9億元，改善了與投資者的關(guān)系，充分維護(hù)了股東的合法權(quán)益。

2006年5月16日，中國(guó)證券報(bào)2005年度上市公司百?gòu)?qiáng)評(píng)選結(jié)果揭曉，“北大荒”列“2005年百?gòu)?qiáng)主榜單”第90名。2006年5月29日，“北大荒”入選中證100指數(shù)樣本股。2006年7月、9月，北大荒農(nóng)業(yè)股份有限公司兩次滾動(dòng)發(fā)行短期融資債券共計(jì)14億元。

2006年12月26日，《2006 黑龍江企業(yè)50強(qiáng)排行榜》在哈爾濱揭曉。公司入選黑龍江省50強(qiáng)企業(yè)第18名。

公司自上市以來(lái)的6年，是規(guī)范運(yùn)作、健康成長(zhǎng)的6年，是公司經(jīng)濟(jì)總量不斷擴(kuò)大、綜合競(jìng)爭(zhēng)實(shí)力顯著增強(qiáng)的6年。企業(yè)呈現(xiàn)經(jīng)濟(jì)快速發(fā)展，效益穩(wěn)健上升的良好態(tài)勢(shì)，誠(chéng)信績(jī)優(yōu)的“北大荒股份”形象進(jìn)一步樹立。公司2006年實(shí)現(xiàn)主營(yíng)業(yè)務(wù)收入45億元，比去年增長(zhǎng)11%；凈利潤(rùn)總額5.3億元，比去年增長(zhǎng)10%。糧豆總產(chǎn)再創(chuàng)新高，實(shí)現(xiàn)糧豆總產(chǎn)量380.9萬(wàn)噸，比上年增長(zhǎng)11%；家庭農(nóng)場(chǎng)人均凈收入達(dá)7100元，比去年增長(zhǎng)11.6%。2007年6月15日，在2006中證百?gòu)?qiáng)的評(píng)比活動(dòng)中，“北大荒”入選中證市值百?gòu)?qiáng)，列第91名。